![[PukiWiki]](image/ROBO192.png "[PukiWiki]")
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| openmpi-common | 1.4.2-4 | high performance message passing library -- common files |
-> [localhost] ~/WRFV3 15:34:15 $ ./configure
checking for perl5... no
checking for perl... found /usr/bin/perl (perl)
** WARNING: No path to NETCDF and environment variable NETCDF not set.
** would you like me to try to fix? [y]
-> y
Enter full path to NetCDF include directory on your system
-> /usr/include
Enter full path to NetCDF library directory on your system
-> /usr/lib
...(中略)
------------------------------------------------------------------------
Please select from among the following supported platforms.
1. Linux x86_64, PGI compiler with gcc (serial)
...(中略)
23. x86_64 Linux, gfortran compiler with gcc (serial)
...(中略)
-> Enter selection [1-34] : 23
------------------------------------------------------------------------
-> Compile for nesting? (0=no nesting, 1=basic, 2=preset moves, 3=vortex following) [default 0]: 0
Configuration successful. To build the model type compile .
...(以下省略)
(更新 : 2013-03-25 (月) 15:48:29)-> ./compileすると、こんな理想化条件が実行できます、というメッセージが出てくるので、2次元の海陸風モデルを選んで実行する。
-> ./compile em_seabreeze2d_x結構な時間をかけてコンパイルすることになる。一番最後に、コンパイルの所要時間が表示された。
build started: 2013年 3月 25日 月曜日 15:46:02 JST build completed: 2013年 3月 25日 月曜日 15:57:42 JST
| 次元 | ケースの名称 | 設定 |
| 1 | em_scm_xy | single column model, 4 km, full physics |
| 2 | em_grav2d_x | gravity current, 100 m |
| 2 | em_hill2d_x | flow over a hill, 2 km |
| 2 | em_seabreeze2d_x | water and land, 2 km, 20km top, full physics |
| 2 | em_squall2d_x | squall line, 250 m |
| 2 | em_squall2d_y | transpose of above problemINITIALIZATION |
| 3 | em_b_wave | baroclinic wave, 100 km |
| 3 | em_fire | surface fire, 50 m |
| 3 | em_heldsuarez | global case with polar filtering, 625 km |
| 3 | em_les | large eddy simulation, 100 m |
| 3 | em_quarter_ss | super cell, 2 km |
| 3 | em_tropical_cyclone | hurricane, 15 km |
-> cd test/em_seabreeze2d_x -> csh ./run_me_first.csh -> ./ideal.exe -> time ./wrf.exe最後に
d01 2007-06-01_17:00:00 wrf: SUCCESS COMPLETE WRFと表示されて実行も終了。time で測った所要時間は次のとおり。
real 4m59.360s user 4m50.266s(更新 : 2013-03-25 (月) 16:15:02)
-> [localhost] ~/WRFV3 15:34:15 $ ./configure
...(中略)
------------------------------------------------------------------------
Please select from among the following supported platforms.
1. Linux x86_64, PGI compiler with gcc (serial)
...(中略)
25. x86_64 Linux, gfortran compiler with gcc (dmpar)
...(中略)
-> Enter selection [1-34] : 25
------------------------------------------------------------------------
...(以下省略)
-> ./compile em_b_wave結構な時間をかけてコンパイルすることになる。一番最後に、コンパイルの所要時間が表示された。
build started: 2013年 3月 25日 月曜日 17:19:28 JST build completed: 2013年 3月 25日 月曜日 17:31:53 JST
-> cd test/em_b_wave -> csh ./run_me_first.csh -> mpirun -n 5 ./ideal.exe -> time mpirun -n 5 ./wrf.exeログは表示されない。mpirun を使って実行するところがミソ。この場合、5個のコアを使っている。time で測った所要時間は次のとおり。
real 3m21.428s user 16m32.850s sys 0m2.952s同じプログラムを serial で実行すると、dmpar では2〜3倍の速さで動いていることがわかる。
real 9m19.641s user 9m2.306s sys 0m14.033s(更新 : 2013-03-25 (月) 18:37:30)
